ABSTRACT
No Estado de São Paulo, a linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus é prevalente em bovinos e equídeos na área rural, transmitida por D. rotundus, enquanto na área urbana ela é prevalente em cães e gatos, transmitida principalmente A. lituratus. Estudo baseado no gene N e G do RABV evidenciou uma possível diferenciação dessa linhagem. Com o objetivo de diferenciar a linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus utilizando todos os genes, foram utilizadas 90 amostras positivas para a raiva, 46 relacionadas epidemiologicamente à D. rotundus e 44 A. lituratus, todas do Estado de São Paulo. Essas amostras foram submetidas a síntese de DNAs randômicos dupla fita, NGS, as sequências foram montadas com software CLCBio e as árvores filogenéticas foram elaboradas por ML utilizando o programa GARLI v.0.96. Os resultados monstraram que os isolados da linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus foram agrupados em quatro sublinhagens filogenéticas, duas associadas ao D. rotundus e duas ao A. lituratus. A árvore filogenética com todos os genes concatenados mostra que a sublinhagem Artibeus 1 foi a primeira a se diferenciar, seguida da linhagem Desmodus 1. Desmodus 2 e Artibeus 2 são sublinhagens irmãs, sendo as últimas a se diferenciarem. Na análise filogenética do gene N com isolados da América Latina, todas as sublinhagens desse estudo tinham a mesma origem, mas diversos isolados de bovinos e D.
Subject(s)
Phylogeny , Rabies virus , ChiropteraABSTRACT
No Brasil, com a adoção da vacinação em cães, houve uma grande redução no número de casos de raiva nessa espécie, principalmente nas regiões Sul e Sudeste. Por outro lado, nas regiões Norte e Nordeste ainda continuam ocorrendo casos de raiva em cães e, com a expansão das áreas urbanas em detrimento das áreas nativas, houve uma maior notificação de raiva em canídeos silvestres. Diante dessa situação, este estudo teve como objetivo realizar a caracterização molecular de vírus da raiva (RABV) isolados de canídeos domésticos e silvestres, procedentes de treze estados da região Norte e Nordeste do Brasil, e analisar em conjunto com sequências já caracterizadas anteriormente (2002-2005). Para isso, foram utilizadas 102 amostras de sistema nervoso central de camundongos previamente inoculados com o RABV provenientes de canídeos domésticos (n=57) e canídeos silvestres (n=45) coletadas no período de 2006 a 2012. As sequências nucleotídicas obtidas para o gene N foram analisadas pelo algoritmo Neighbor-Joining e modelo evolutivo Kimura-2-parâmetros utilizando o programa MEGA 6. A análise filogenética mostrou a presença de duas linhagens distintas do RABV (canídeos e morcegos) e, dentro do cluster dos isolados de canídeos, foi observado duas sublinhagens distintas circulando entre canídeos domésticos e silvestres. Além disso, foi evidenciado dentro dos isolados de canídeos a presença de 13 grupos filogenéticos relacionados à região geográfica e 14 casos de infecções interespécies. Esse estudo mostra que a epidemiologia molecular realizada de uma forma constante possibilita a compreensão da circulação do RABV nas diferentes regiões geográficas e possibilita estabelecer medidas de controle e prevenção da doença.